Les Marais communaux de Pierrepont sont intégrés à l’ensemble des marais de la Souche. Ce dernier abrite un vaste ensemble d’habitats tourbeux de haute valeur patrimoniale. Les sites de Pierrepont sont caractérisés par une multitude d’étangs, témoins pour partie d’une exploitation ancienne de la tourbe. L’abandon des pratiques de pâturage, fauche et tourbage a entraîné un boisement important de ces marais. La préservation du site permet de retrouver, au sein de ces étangs, une végétation aquatique à Characées et en marge une mosaïque de roselières à Massette à feuilles étroites, à Roseau commun et à Laîche des marais. Les habitats prairiaux présentant le plus d'intérêt sont la prairie à molinie et Gentiane pneumonanthe, les milieux pionniers à Souchet jaunâtre et la Cladiaie.