La Mûche de Chirmont revêt un intérêt exceptionnel pour la protection de certaines espèces de chauves-souris de la région Picardie. En hiver, la cavité souterraine sert de gîte d’hibernation à plusieurs espèces de chiroptères. Sans cette préservation, le dérangement des chauves-souris peut conduire à une mort par faim et épuisement. En effet, la perturbation, provoquant une soudaine sortie de léthargie, a pour conséquence une surconsommation de leur réserve graisseuse.