Le Marais de Lhuys constitue avec le marais de Branges un ensemble de tourbières alcalines dans lequel se trouvent de nombreux habitats naturels de forte valeur patrimoniale. Le site a un intérêt exceptionnel au niveau régional et national grâce à des habitats comme le layon fauché à Laîche de Davall, les prairies à Molinie bleue, les cladiaies ou encore les roselières à Fougères des marais. Ces habitats sont le refuge d’une flore et d’une faune remarquables.